Calleja était l'organisateur et le chef de l'armée centrale (1810-12) pendant la guerre d'indépendance et le soixantième vice-roi de la Nouvelle-Espagne, au pouvoir de 1813 à 1816, étant l'un des grands méchants de l'histoire du Mexique.
Il est né à Medina del Campo, Valladolid, et est mort à Valence. Il fit sa première campagne en tant que sous-lieutenant dans la malheureuse expédition d'Alger qui, sous le règne de Charles III, était dirigée par le comte O'Reilly. Il était professeur et capitaine d'une compagnie de 100 cadets, dont Joaquín Blacke, régent après l'Espagne, et Francisco Javier de Elío, futur vice-roi de Buenos Aires, à l'école militaire de Puerto de Santa María.
Il arrive en Nouvelle-Espagne avec le second comte de Revillagigedo (1789), en tant que capitaine attaché au régiment d'infanterie fixe de Puebla, et exécute avec succès plusieurs commissions jusqu'à ce qu'il soit nommé commandant de la brigade de San Luis Potosí. Là, il avait sous son commandement le canton des troupes chargé de se rassembler par le vice-roi Marquina, qui était accompagné avec sa compagnie du capitaine Ignacio Allende. Là, il épousa aussi Doña Francisca de la Gándara, fille de l'enseigne royale de cette ville, propriétaire de la grande Hacienda de Bledos; et il acquit une grande influence sur les gens du pays, qui le connaissaient comme «le maître Don Félix».
Lorsque l'insurrection d'Hidalgo eut lieu, sans attendre les ordres du vice-roi, il mit les troupes de sa brigade sur les bras, les augmenta de nouvelles et les organisa et les disciplina, il forma la petite (4000 hommes) mais puissante armée du centre, qui réussit à vaincre Hidalgo et affrontez la formidable offensive lancée par Morelos.
Calleja se retira au Mexique après le siège de Cuautla (mai 1812), il avait dans sa résidence (Casa de Moncada, plus tard appelée Iturbide Palace) sa petite cour où le mécontentement avec le gouvernement de Venegas concordait, qu'ils accusaient de manquer d'argent et impuissants à contenir et à mettre fin à la révolution. Environ 4 ans plus tard, il dirigeait le pays en tant que vice-roi. Il compléta l'armée en la faisant atteindre 40 000 hommes de troupes de ligne et de milices provinciales, et autant de royalistes organisés dans toutes les villes et domaines, certains d'entre eux partant pour la plupart des provinces elles-mêmes en révolution; il réorganisa le Trésor public, dont les produits augmentaient avec de nouveaux impôts; il rétablit le trafic marchand avec les convois fréquents qui repartaient d'un bout à l'autre du royaume et le service postal régulier; et a augmenté la performance et les produits douaniers.
Cela suppose les campagnes continues et intenses qu'il a promues contre les insurgés, dans lesquelles Morelos a succombé. Homme déterminé et sans scrupules, il ne s'est pas arrêté dans les médias et a fermé les yeux sur les abus que ses commandants ont commis, s'ils servaient la vraie cause avec zèle. Il est ainsi devenu haineux pour ses contemporains.
De retour en Espagne, il reçoit le titre de comte de Calderón (1818) et les grandes croix d'Isabel la Católica et de San Hermenegildo. Après avoir été capitaine général d'Andalousie et gouverneur de Cadix, il a commandé les troupes expéditionnaires d'Amérique du Sud, qui se sont levées avant de partir et l'ont réduit en prison (1820). Libéré, il refusa le gouvernement de Valence et fut de nouveau emprisonné, à Majorque, jusqu'en 1823. «Purifié» en 1825, il resta dans la caserne de Valence jusqu'à sa mort.
