Il participe à la conspiration de Valladolid en 1809 et s'installe à Querétaro où il assiste aux réunions du magistrat Miguel Domínguez et de son épouse.
En septembre 1810, San Miguel commanda le régiment Queen's Dragoons. Là, il est informé que le complot a été trahi. Il se rend à Dolores et informe Allende et Hidalgo de ce qui s'est passé, donc le soulèvement est avancé.
Il appréhende plusieurs personnages réalistes et est chargé de veiller sur les prisonniers espagnols. Participez à la bataille de Monte de las Cruces. Marche vers Guanajuato et Zacatecas avec Allende.
Il fut fait prisonnier à Acatita de Baján et fusillé à Chihuahua en juin 1811. Sa tête fut exposée à l'Alhóndiga de Granaditas jusqu'en 1821. Deux ans plus tard, il est déclaré héros national.
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