La Encrucijada présente plusieurs types de végétation typique de la zone côtière, considérée comme le système de zones humides le plus important de la côte du Pacifique américain, principalement en raison de son extension, de sa structure et de sa productivité élevée.
Dans la zone, il y a aussi la seule communauté de forêt de plaine inondable du pays représentée par Manilkara zapota zapotonales, ainsi que de vastes zones de tulares Typha latifolia, popales de Thalia et Pontederia dominée par les graminées Phragmites australis, avec des systèmes lagunaires et la présence de quelques parcelles formées par des forêts moyennes et low subperennifolia, c'est pourquoi elle a été considérée comme une zone stratégique de zones humides nécessitant une gestion adéquate et une conservation prioritaire.
Il y a des centaines de kilomètres carrés recouverts d'eau saumâtre dans lesquels il n'y a pas de végétation capable de survivre, à l'exception de la mangrove, des arbustes et des arbres qui ici atteignent un développement unique et vous pouvez trouver les quatre espèces qui composent les mangroves: la mangrove rouge Rhizophoramangle, la mangrove noire Avicennia germinans, la mangrove blanche Laguncularia racemos et la mangrove à boutons Conecarpus erectus. Dans certains endroits, ils donnent naissance à de grandes forêts de mangroves atteignant 35 m de haut; Cela les rend considérés comme les plus élevés de l'hémisphère nord et d'Amérique centrale.
Peut-être cette plante livrera-t-elle un jour son grand secret: elle est à elle seule un laboratoire végétal plongé dans l'eau salée, et de là ses racines prélèvent le sel, le séparent et l'éliminent par la transpiration de ses feuilles. Chaque plante de mangrove devient alors tout un système immobile qui n'utilise pas plus de carburant que les rayons du soleil.
