Comme ils ne savaient pas jusqu'où s'étend le nord du pays, les jésuites sont arrivés à Chihuahua. Au XVIIe siècle, l'état actuel était constitué dans sa partie sud-ouest par ce que l'on appelait la région de Chínipas, tandis que le reste du territoire était divisé entre la haute et la basse Tarahumara.
Les premières tentatives d'évangélisation de Chihuahua sont venues des voyages effectués par les jésuites, précédemment installés dans l'état de Sinaloa. Le premier à être construit dans la région fut celui érigé par le père Juan Castini en 1621 et connu sous le nom de mission Chínipas.
Les jésuites travaillaient dans les montagnes parmi les Indiens Tepehuanes, Guazaparas et Tarahumara, tandis que les franciscains travaillaient dans les vallées et les plaines. Le premier missionnaire stable dans la région de Chínipas fut le père jésuite Julio Pascual, martyrisé en 1632 avec le père Manuel Martínez. En 1680, Fray Juan María Salvatierra a donné une impulsion vigoureuse à la mission, qui a été consolidée dans les années 1690 et 1730. Au milieu du 17ème siècle, les missions jésuites de la région de Chínipas sont devenues l'une des mieux organisées et avancées.
Au sud se trouvait le Nabogame où vous pouvez encore voir l'église, le curé et la maison de mission que le père Miguel Wiytz construisit en 1744. Baborigame Satevo est situé dans la même zone, qui a pris une nouvelle vigueur avec l'administration du père Luis Martín. et Tubares, fondée en 1699 par le père Manuel Ordaz et relancée par l'administration de l'historien Félix Sebastián. Ce dernier était considéré comme l'un des plus riches en église, maison, bétail et ranchs. Au centre se trouvent les missions de Cerocahui, Guazapares, Chínipas, Santa Ana et au nord Babarocos et Moris.
La région de Tarahumara Baja a été évangélisée pour la première fois par le père Juan Fonte, qui a fait sa première entrée en 1608. En 1639, le père Jerónimo Figueroa a construit la mission de San Pablo Balleza et celle de Huejotitán (San Jerónimo), tandis que le père José Pascual construisait en même temps San Felipe. Dans la même région de Tarahumara se trouvent également La joya, Santa María de las Cuevas et San Javier Savetó, cette dernière mission construite en 1640 par le Père Virgilio Máez.
En ce qui concerne le territoire de la Tarahumara Alta, qui englobe le centre et le nord de cette entité, le travail d'évangélisation a commencé par les Pères Tardá, Guadalajara, Celada, Tarkay et Neuman. Les missions incluses dans cette région étaient: Tonachi, Norogachi, Nonoava, Narárachi, Sisoguichi, Carichi, San Borja, Temechí ou Temeichi, Coyachi ou Coyachic, Tomochi ou Tomochic, Tutuaca ou Tutuata, Papigochi, Santo Tomás, Matachi et Tesomachi. Au milieu du XVIIe siècle, la mission jésuite de Chihuahua est devenue la mieux organisée et administrée, à l'exception de celles de Californie.
Dans le territoire de Chihuahuan, il y avait aussi le travail missionnaire des franciscains. L'objectif des religieux était de compléter le lien qui existait déjà au nord de Zacatecas, pour lequel ils fondèrent des couvents à Chihuahua et Durango. Les couvents, comme les jésuites, devaient remplir l'objectif d'évangéliser les infidèles. Les bâtiments construits étaient ceux de Notre-Dame du Nord, qui est maintenant Ciudad Juárez, San Buenaventura de Atotonilco (Villa López), Santiago Babonoyaba, Parral, Santa Isabel de Tarahumara, San Pedro de los Conchos, Bachiniva ou Bacínava (Notre-Dame de la Nativité ), Namiquipa (San Pedro Alcántara), Carretas (Santa María de Gracia), Julimes, San Andrés, Nombre de Dios, San Felipe el Real de Chihuahua et Casas Grandes.
