L'histoire de la ville qui s'appelait à l'origine le Royaume de la Nouvelle Galice se poursuit.
Il y a aussi l'ancien collège jésuite de Santo Tomás de Aquino, construit dans la dernière décennie du XVIe siècle et qui, en 1792, était occupé par l'Université. De la construction, il ne reste que ce qui était l'église, avec son dôme monumental du siècle dernier, et la chapelle de Loreto attenante, construite en 1695 par Juan María de Salvatierra. Le temple de San Juan de Dios, qui était autrefois la chapelle de Santa Veracruz, construit au XVIe siècle par Don Pedro Gómez Maraver, a été construit au XVIIIe siècle avec une façade baroque aux caractéristiques sobres. L'église de La Merced, de style baroque semblable à celui de San Juan de Dios, bien que plus ornée, a été fondée au XVIIe siècle par les frères Miguel Telmo et Miguel de Albuquerque.
Le temple de La Soledad a été construit vers la fin du 17ème siècle et le début du 18ème à la demande de Juana Romana de Torres et de son mari, le capitaine Juan Bautista Panduro. À cet endroit se trouvait la confrérie de Notre-Dame de la Solitude et du Saint-Sépulcre, occupant une chapelle dédiée à San Francisco Xavier. Le temple et école de San Diego, oeuvre du siècle XVII; le premier avec une porte très sobre qui semble déjà appartenir au style néoclassique et le second avec une belle arcade qui orne son ancien cloître.
L'église de Jesús María, rattachée au couvent du même nom, a été fondée en 1722; il conserve encore ses façades baroques, sur lesquelles on peut voir de grandes sculptures représentant la Sagrada Familia, la Virgen de la Luz, San Francisco et Santo Domingo.
Enfin, il est important de souligner trois autres constructions religieuses qui se sont révélées les meilleurs exemples, chacune en son genre, du développement de l'architecture coloniale à Guadalajara, principalement entre les XVIIe et XVIIIe siècles. Ainsi, nous avons la chapelle Aránzazu, du milieu du XVIIIe siècle, avec son curieux beffroi et son intérieur décoré de magnifiques peintures et retables churrigueresques de la même période et considérés comme les meilleurs de la ville. Le couvent et l'église de Santa Mónica, fondés par le père Feliciano Pimentel dans la première moitié du XVIIIe siècle; son temple présente une double façade avec une riche ornementation cataloguée comme le meilleur exemple du style baroque salomonien exubérant. Le temple de San Felipe Neri, construit en 1766 par l'architecte Pedro Ciprés, forme un ensemble d'une sobriété extraordinaire qui intègre des éléments aux réminiscences plateresques dans son ornementation, un aspect qui place le temple comme le meilleur édifice religieux de Guadalajara.
Dans les constructions qui correspondent à l'architecture civile, il y a quelques bâtiments admirables, parmi lesquels on peut citer le Palais du Gouvernement, anciennes maisons royales qui ont été modifiées au 18ème siècle suite à un projet de l'ingénieur militaire Juan Francisco Espino, bien que la façade ait été œuvre de Miguel José Conique. Le bâtiment a été conçu essentiellement dans le style baroque, mais certaines tendances néoclassiques y sont déjà visibles. Les bureaux royaux, qui se trouvaient dans le Palacio de Medrano disparu, et les salles d'audience fonctionnaient sur place.
Nous avons également ce qui était le Séminaire conciliaire dédié à San José, inauguré par Mgr Galindo y Chávez en 1701, aujourd'hui occupé par le Musée régional de Guadalajara, avec son cloître principal de colonnes de style toscan et ses portes baroques. Le célèbre Hospicio Cabañas construit au début du XIXe siècle, sur les plans de l'illustre architecte Manuel Tolsá, dirigeant l'œuvre José Gutiérrez et achevé des années plus tard par l'architecte Gómez Ibarra, et qui constitue un exemple notable du style néoclassique.
Parmi les autres constructions mineures qui ont fourni une unité stylistique à la ville de Guadalajara, nous pouvons citer, bien que toutes ne soient pas conservées: le majestueux manoir du XVIe siècle qui se dressait devant ce qui était autrefois la place Saint-Sébastien dans le quartier Analco. La maison de la Calle de la Alhóndiga n ° 114, actuellement Pino Suárez. Les résidences qui appartenaient à la famille Sánchez Leñero au n ° 37 et celle de M. Dionisio Rodríguez au n ° 133 de la rue de Alcalde. La maison Calderón, une confiserie coloniale traditionnelle fondée en 1729 et située au coin des vieilles rues de Santa Teresa et Santuario, aujourd'hui Morelos et Pedro Loza; celui de Francisco Velarde, de style néoclassique, et enfin celui qui fut le manoir Cañedo, situé en face de l'arrière de la cathédrale.
Dans les environs de Guadalajara, la troisième ville la plus importante du pays, se trouve la vieille ville de San Juan Bautista Melzquititlán, aujourd'hui San Juan de los Lagos. Cette ville est devenue un centre religieux important en raison de la grande tradition miraculeuse de l'image de la Vierge Marie qui conserve sa basilique, construite au milieu du XVIIe siècle par Don Juan Rodríguez Estrada. Dans la même ville, vous pouvez voir d'autres constructions telles que le Temple du Tiers Ordre, la Chapelle du Calvaire, la Chapelle du Premier Miracle, datant des XVIIe et XVIIIe siècles. Il y a aussi des bâtiments civils importants dans la population, tels que le palais du Collège et le bâtiment des dîmes, entre autres.
Dans la ville de Lagos de Moreno, vous pouvez voir sa paroisse principale, une œuvre du 17ème siècle avec une belle façade dans le style Churrigueresque.
Enfin, à San Pedro Tlaquepaque, il y a quelques exemples d'architecture religieuse baroque dans la région, comme la paroisse de San Pedro et le temple de Soledad.
