Hidalgo partit pour Aguascalientes et se dirigea vers Zacatecas. De Zacatecas, Hidalgo est passé par les Salinas, le Venado, les Charcas, le Matehuala et le Saltillo.
Ici, il était décidé que les principaux chefs, avec les meilleures troupes et l'argent, partiraient pour les États-Unis. Déjà en route, ils ont été faits prisonniers par les royalistes le 21 mars aux Norias del Baján ou Acatita del Baján. Hidalgo a été emmené à Monclova, de là il est parti le 26 mars à travers l'Alamo et Mapimí et le 23 il est entré à Chihuahua. Ensuite, le processus a été formé et le 7 mai, la première déclaration a été prise. Le caractère ecclésiastique d'Hidalgo a retardé son procès plus que celui de ses compagnons: la rétrogradation a été prononcée le 27 juillet et le 29 juillet, il a été exécuté à l'hôpital royal où Hidalgo était emprisonné. Le Conseil de guerre a condamné le prisonnier à être mis aux armes, pas dans un lieu public comme ses compagnons, et à lui tirer une balle dans la poitrine et non dans le dos, préservant ainsi sa tête. Hidalgo entendit calmement la phrase et se prépara à mourir.
Son dernier jour a été décrit comme suit: «De retour dans sa prison, on lui a servi un petit déjeuner au chocolat, et l'ayant pris, il a supplié qu'au lieu de l'eau soit servi un verre de lait, qu'il a terminé avec une extraordinaire démonstration d'appétit et de plaisir. Un instant plus tard, on lui a dit que le moment était venu d'aller à la torture; il l'entendit sans altération, se leva et déclara qu'il était prêt à partir. En effet, il sortit du cube hideux dans lequel il se trouvait, et s'étant éloigné de quinze ou vingt pas, il s'arrêta un instant, parce que l'officier de garde lui avait demandé si on lui offrait quelque chose pour disposer du dernier; A cela il a répondu que oui, il voulait qu'ils lui apportent des bonbons qu'il avait laissés sur ses oreillers: ils les ont effectivement apportés, et les ayant distribués parmi les mêmes soldats qui allaient l'incendier et marchaient derrière lui, il les encouragea et les réconforta par son pardon et ses mots les plus doux pour faire leur travail; Et comme il savait très bien qu'on lui avait ordonné de ne pas tirer sur sa tête, et qu'il craignait de souffrir beaucoup, car il faisait encore crépuscule et les objets n'étaient pas clairement vus, il a conclu en disant: «La main droite que je mettrai sur ma poitrine sera , mes enfants, la cible sûre vers laquelle vous devez aller ».
«Le banc de torture avait été placé là dans un corral intérieur de l'école référée, contrairement à ce qui a été fait avec les autres héros, qui ont été exécutés sur la place derrière le bâtiment, et où se trouve le monument aujourd'hui. cela nous rappelle lui, et le nouveau centre commercial qui portait son nom; et quand l'Hidalgo eut connaissance du lieu auquel il était adressé, il marcha d'un pas ferme et serein, et sans se laisser les yeux bandés, priant d'une voix forte et fervente le psaume Miserere me; Il est arrivé à l'échafaud, l'a embrassé avec résignation et respect, et malgré une altercation qui ne l'a pas fait asseoir le dos tourné, il a pris le siège face à l'avant, il a posé sa main sur son cœur, il a rappelé aux soldats que c'était le point où ils devraient lui tirer dessus, et un instant plus tard, la volée de cinq fusils a explosé, dont l'un a effectivement percé la main droite sans blesser le cœur. Le héros, presque impassible, tendit sa prière, et leurs voix se turent quand cinq autres muselières de fusil explosèrent à nouveau, dont les balles, passant le corps, rompirent les liens qui le liaient au banc, et l'homme tomba dans un lac de sang, il n'était pas encore mort; trois autres coups de feu ont été nécessaires pour conclure cette existence précieuse, qui respectait la mort depuis plus de 50 ans. "
Le soleil était à peine né qu'il s'était déjà mis à la vue du public, sur une chaise et à une hauteur considérable, et précisément à l'extérieur du sien. Sa tête, avec celles d'Allende, d'Aldama et de Jiménez, ont été placées dans des cages de fer aux coins de l'Alhóndiga de Granaditas à Guanajuato. Le corps a été enterré dans le troisième ordre de San Francisco de Chihuahua, et en 1824 le tronc et la tête ont été amenés au Mexique, pour être enterrés avec une grande solennité.
